Die Hochschulleitung setzt sich zusammen aus Rektor, Prorektor und Studienleiter. Zur Hochschulleitung gehören derzeit: Rektor Prof. Dr. Andreas Heiser, Prorektor Prof. Dr. Julius Steinberg und Studienleiter Prof. Dr. Markus Iff.
Der Senat ist das zentrale Selbstverwaltungsorgan der Theologischen Hochschule Ewersbach. Er entscheidet über grundsätzliche Angelegenheiten von Lehre, Forschung und Studium. Dem Senat gehören an: die Hochschulleitung (Rektor, Prorektor, Studienleiter), alle Professoren sowie ein Vertreter der hauptamtlichen Lehrbeauftragten, vier Studierende sowie ein Vertreter der Hochschuladministration. Den Vorsitz hat Prof. Dr. Julius Steinberg inne. Anträge zur Tagesordnung sind an den Senatsvorsitzenden zu richten.
Die immatrikulierten Studierenden diskutieren, planen und ordnen ihre Interessen und Belange des Studierens und Lebens auf dem Campus und setzen dafür die Studierendenvertretung ein. Der oder die Studierendensprecher/in vertritt die Anliegen der Studierenden gegenüber der Hochschulleitung, den Lehrenden und den verantwortlichen Mitarbeitenden, bringt Anträge der Studierenden in den Senat ein und repräsentiert die Studierenden. Studierendensprecherin für das Studienjahr 2025-2026 ist Lisa Schletter (BA, 3. Studienjahr).
Der Hochschulrat berät die Theologische Hochschule Ewersbach, die Erweiterte und die Geschäftsführende Bundesleitung des Bundes Freier evangelischer Gemeinden in wissenschaftlichen Angelegenheiten, bei der Weiterentwicklung des Studienprogramms sowie in personellen und materiellen Fragestellungen. Zum Hochschulrat gehören derzeit: